Enzymy są środkami czyszczącymi pochodzenia biologicznego. Są to silne składniki, które działają na określone rodzaje plam, tzn. do jednego rodzaju plamy istnieje jeden rodzaj enzymu. Działają jak katalizatory, dzięki czemu każda cząsteczka działa więcej niż raz.
Głównymi enzymami stosowanymi w zmywaniu naczyń są proteazy i amylazy. Proteazy usuwają białka, np. z jaj, przypalonego mięsa lub sera. Amylazy usuwają cukier i skrobię, np. z makaronów, ziemniaków, ryżu i zbóż, takich jak pszenica czy kukurydza.
Stosujemy różne enzymy do usuwania określonych rodzajów plam, takich jak białka, skrobia lub plamy z produktów spożywczych. Enzymy aktywne na zimno dodatkowo pomagają usuwać plamy już w niskich temperaturach mycia, np. 20° lub 30°C.